L'Agence eSanté a pour mission principale de faciliter le partage et l'échange de données de santé du patient entre les professionnels de santé impliqués dans son parcours de santé.
Suivant les dispositions de l’article 60ter et 60quater du Code de la Sécurité Sociale il lui incombe le rôle d’assurer une meilleure utilisation des informations dans le secteur de la santé et le secteur médico-social afin d’assurer une meilleure prise en charge coordonnée du patient.